Weener war seit der Reformation reformiert. Die lutherische Erlöserkirche wurde am 15. November 1953 eingeweiht. Eine lutherische Gemeinde konnte zum 1. Oktober 1955 gegründet werden. Zu ihr gehören auch die Lutheraner aus Neuweener, Holthusen, Möhlenwarf, Stapelmoor und Tichelwarf.
Seit Januar 2021, besteht eine pfarramtliche Verbindung mit der lutherischen Gemeinde in Bunde. Beide Gemeinden gehören seit Januar 2013 zum Kirchenkreis Rhauderfehn.
Es bestehen gute ökumenische Verbindungen mit den übrigen Gemeinden in Weener: der reformierten, der katholischen, der baptistischen und der Pfingstgemeinde.